59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4224 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
389 aa  798    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  39.75 
 
 
406 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  37.5 
 
 
396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  33.14 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  33.45 
 
 
386 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.33 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  32.74 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.97 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.8 
 
 
470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  28.92 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  29.6 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  29.28 
 
 
458 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  31.31 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.19 
 
 
617 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  32.58 
 
 
399 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  29.84 
 
 
368 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  26.45 
 
 
377 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.44 
 
 
349 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  28.02 
 
 
422 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  30.36 
 
 
539 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  28.52 
 
 
375 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  28.52 
 
 
375 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  27.86 
 
 
390 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  29.28 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  28.65 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  30.65 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  28.88 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.66 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  26.43 
 
 
375 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  31.75 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  32.74 
 
 
369 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  32.98 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  28.07 
 
 
650 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  26.47 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  29.05 
 
 
365 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  30.77 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.62 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  30.8 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  30.84 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  30.84 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.86 
 
 
638 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  27.73 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  30.3 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  28.87 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  32.69 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  39.42 
 
 
159 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  34.59 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  25.73 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  23.3 
 
 
353 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  32.19 
 
 
405 aa  56.2  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.36 
 
 
330 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.05 
 
 
589 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  28.28 
 
 
130 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  28.3 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  25.56 
 
 
194 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  26.35 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>