64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2195 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  792    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  46.28 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  47.11 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  42.82 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  40.28 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  38.08 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  36.16 
 
 		 353 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  30 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  30.12 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  28.18 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  33.16 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.2 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  28.36 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  30.14 
 
 		 638 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  30.7 
 
 		 345 aa  96.3  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  29.5 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  29.5 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  27.16 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.67 
 
 		 617 aa  93.2  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  25.7 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  36.77 
 
 		 650 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  28.29 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.63 
 
 		 539 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.38 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 389 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  28.79 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  23.33 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  28.79 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.32 
 
 		 470 aa  86.7  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.43 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  32.07 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.68 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  27.69 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  28 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.05 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  27.12 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  28.65 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.07 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  36.73 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  27.9 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  25.94 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  24.25 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.17 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  28.99 
 
 		 130 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  28.34 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.21 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  23.75 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  26.25 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  32.69 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.5 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  25.58 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  21.67 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  24 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  22.73 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  32.58 
 
 		 159 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  28.39 
 
 		 168 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.22 
 
 		 589 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  28.79 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  29.93 
 
 		 756 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  31.25 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  22.77 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  29.41 
 
 		 603 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  30.95 
 
 		 555 aa  43.1  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>