78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0057 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 341 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  34.11 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  33.14 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  30.88 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  37.98 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  33.63 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  30.4 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.37 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.65 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.37 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  29.03 
 
 		 402 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  30.12 
 
 		 409 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  30.35 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  31.37 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  31.37 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  30.47 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  34.38 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  25.89 
 
 		 539 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  28.88 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  27.72 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  32.81 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  31.11 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  26.97 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.2 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  27.27 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  26.74 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  28.7 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.81 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  27.68 
 
 		 617 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  26.5 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  26.5 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.21 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.93 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  27 
 
 		 379 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  27.16 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  29.55 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  25.72 
 
 		 458 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.5 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  24.16 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  34.01 
 
 		 650 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  31.48 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  32.77 
 
 		 343 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  26.3 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.85 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  28.44 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  27.75 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28.22 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  31.31 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.67 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  31.31 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.75 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  37.86 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  24.4 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  25.91 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  28.85 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  26.26 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  26.38 
 
 		 589 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  38.33 
 
 		 390 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  26.95 
 
 		 360 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  25.71 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  31.96 
 
 		 760 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  29.47 
 
 		 570 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  24.09 
 
 		 584 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1618  hypothetical protein  24.32 
 
 		 548 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465125  hitchhiker  0.0000786567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  25.11 
 
 		 705 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  26.21 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  30.21 
 
 		 753 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  26.88 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  31.4 
 
 		 576 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  25.68 
 
 		 194 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  25.58 
 
 		 754 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  25.58 
 
 		 754 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  27.47 
 
 		 575 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  24.39 
 
 		 573 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  35.21 
 
 		 555 aa  42.7  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>