111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1820 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  98.75 
 
 		 562 aa  1142    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1160    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  39.29 
 
 		 555 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  33.56 
 
 		 573 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  28.39 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  27.52 
 
 		 584 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  27.52 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  27.63 
 
 		 585 aa  196  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  27.21 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  29.57 
 
 		 689 aa  171  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  25.22 
 
 		 550 aa  143  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2178  hypothetical protein  42.24 
 
 		 234 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  22.87 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.17 
 
 		 573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  25.68 
 
 		 692 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2270  hypothetical protein  46.09 
 
 		 269 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.48 
 
 		 600 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  22.37 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  29.24 
 
 		 563 aa  97.8  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  25.27 
 
 		 659 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.01 
 
 		 526 aa  94.4  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  29.18 
 
 		 529 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  30.59 
 
 		 646 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  27.9 
 
 		 591 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  21.54 
 
 		 578 aa  91.3  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  27.46 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25 
 
 		 842 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  22.98 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  22.33 
 
 		 596 aa  89.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  23.54 
 
 		 722 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  30.6 
 
 		 559 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  28.21 
 
 		 723 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  28.4 
 
 		 649 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  27.94 
 
 		 606 aa  84.7  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.53 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  22.43 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  25.3 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  27.73 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  27.73 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  24.27 
 
 		 619 aa  80.9  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  27.49 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  26.38 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  24.91 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.73 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  37.41 
 
 		 172 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  26.29 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.69 
 
 		 641 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  23.55 
 
 		 695 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  24.64 
 
 		 707 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  31.43 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  24.44 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  23.98 
 
 		 704 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  25.31 
 
 		 619 aa  72.4  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  28.63 
 
 		 664 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.62 
 
 		 699 aa  70.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  45.57 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  26.67 
 
 		 612 aa  70.9  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  24.44 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  23.16 
 
 		 697 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  26.52 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  27.23 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  20.58 
 
 		 568 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  22.77 
 
 		 697 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  20.5 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  23.05 
 
 		 695 aa  68.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  23.01 
 
 		 656 aa  67.8  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.01 
 
 		 772 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.26 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  25.17 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  26.64 
 
 		 498 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  27.23 
 
 		 588 aa  63.9  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.39 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  44.62 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  41.56 
 
 		 689 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  26.85 
 
 		 709 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  25.31 
 
 		 785 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  25.61 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  22.92 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  41.3 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  25.75 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  23.65 
 
 		 609 aa  60.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.76 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.09 
 
 		 726 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  26.29 
 
 		 835 aa  58.2  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  27.08 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  21.07 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  24.77 
 
 		 621 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  27.08 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  38.14 
 
 		 602 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  34.83 
 
 		 564 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  25.19 
 
 		 629 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  35.29 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  25.83 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0247  hypothetical protein  25.71 
 
 		 714 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  31.82 
 
 		 223 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  36.78 
 
 		 780 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  29.77 
 
 		 656 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  36.71 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>