63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1629 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  734    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  46.97 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  42.15 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  40.24 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  38.08 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  39.03 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  37.65 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.56 
 
 		 349 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  32.81 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  31.31 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  28.3 
 
 		 354 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.24 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  32.98 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.2 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  29.05 
 
 		 389 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  28.37 
 
 		 378 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  29.33 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  23.64 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  29.9 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  23.64 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.97 
 
 		 638 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  28.11 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  29.96 
 
 		 617 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.07 
 
 		 539 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  29.73 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.46 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  29.07 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  33.52 
 
 		 650 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  29.28 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  28.44 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.89 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  28.7 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  31.91 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.03 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  32.1 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  30.43 
 
 		 130 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.5 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.36 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  27.17 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  24.58 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  28.46 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  28.46 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.32 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  23.81 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  25.56 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  25.45 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.79 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  29.01 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.27 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  24.2 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  25.64 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  25.88 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  22.82 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  21.76 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 705 aa  53.5  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  26.09 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  21.76 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  32.05 
 
 		 548 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  34.09 
 
 		 591 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  36.05 
 
 		 135 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  24.64 
 
 		 194 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>