60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0278 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  803    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  53.8 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  52.94 
 
 		 159 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  29.66 
 
 		 386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  30.37 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  33.14 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31.96 
 
 		 470 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  32.2 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  28.94 
 
 		 617 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  30.38 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  30.14 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  28.45 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.97 
 
 		 341 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  31.31 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  29.03 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  29.46 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  31.44 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.51 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  26.97 
 
 		 377 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.72 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.61 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.68 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  30.04 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.79 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  27.02 
 
 		 353 aa  93.6  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  25.98 
 
 		 458 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  27.82 
 
 		 374 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  29.22 
 
 		 370 aa  92.8  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.62 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  25.28 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  28 
 
 		 539 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  32.63 
 
 		 650 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  26.02 
 
 		 638 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  32.26 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.15 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  26.77 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  32.68 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  25.76 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  34 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  34 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  25.94 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.57 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.57 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  27.36 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  30.23 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.88 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  31.06 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.49 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  23.68 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  26.7 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  25.4 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  29.93 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  23.31 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  41.1 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  33.01 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  22.02 
 
 		 344 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  26.21 
 
 		 168 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>