53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3198 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  801    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  45.57 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  29.55 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  29.22 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  40 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  33.33 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  25.54 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  40 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  30.38 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  26.58 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  32.71 
 
 		 159 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  40.62 
 
 		 370 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  41.1 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  33.72 
 
 		 349 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  38.33 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  29.63 
 
 		 650 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  32.58 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  40.98 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  31.46 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  26.39 
 
 		 353 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.21 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  42.86 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  34.29 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  39.06 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  34.38 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  39.68 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.27 
 
 		 375 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.78 
 
 		 638 aa  47.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  32.84 
 
 		 367 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  29.21 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  29.67 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 589 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  30.65 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.14 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  29.09 
 
 		 617 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  38.46 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.81 
 
 		 753 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  25.86 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.35 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0922  hypothetical protein  27.97 
 
 		 539 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  25.64 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  31.25 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.83 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  29.67 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  25.14 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  25.14 
 
 		 375 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  32.89 
 
 		 368 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>