67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3053 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  36.93 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  33.68 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  33.45 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  30.68 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  30.75 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  34.77 
 
 		 341 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  28.77 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  32.95 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  28.83 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  30.55 
 
 		 366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  30.53 
 
 		 399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.96 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  30.34 
 
 		 377 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  31.09 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  28.33 
 
 		 617 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  33.19 
 
 		 539 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  31.67 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  29.13 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  29.21 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  29.65 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.68 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.68 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  31.72 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  31.72 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  29.14 
 
 		 368 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  26.46 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  30.6 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  30.17 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  31.37 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  31.52 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.15 
 
 		 409 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  27.87 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  33.17 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  25.79 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  28.47 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  26.73 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  37.2 
 
 		 650 aa  96.3  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  32.98 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  27.83 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  25.24 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  26.95 
 
 		 368 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  29.73 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  32.71 
 
 		 638 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  24.24 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  23.32 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  26.25 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  33.5 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  31.64 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  38.39 
 
 		 159 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  27.53 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  29.95 
 
 		 589 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  37.14 
 
 		 135 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  30.63 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  25.24 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  31.14 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  25.27 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  24.29 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  26.18 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  34.38 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  39.73 
 
 		 588 aa  46.6  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  26.99 
 
 		 499 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  33.73 
 
 		 615 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  28.85 
 
 		 617 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  30.95 
 
 		 753 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 		 588 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>