58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0134 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  58.56 
 
 
378 aa  421  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  57.77 
 
 
379 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  41.83 
 
 
368 aa  255  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  39.47 
 
 
617 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  37.7 
 
 
458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  31.94 
 
 
650 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  32.98 
 
 
539 aa  153  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  33.04 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  31.72 
 
 
638 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  30.57 
 
 
375 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  32.18 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  26.82 
 
 
371 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
389 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.52 
 
 
470 aa  113  5e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.66 
 
 
397 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  33.83 
 
 
345 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  29.88 
 
 
406 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  32.02 
 
 
349 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.85 
 
 
377 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  32.12 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.95 
 
 
422 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.13 
 
 
354 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  31.69 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  29.3 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  28.76 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.19 
 
 
391 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  26.69 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  26.56 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  26.56 
 
 
375 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  26.85 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  24.4 
 
 
374 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  28.63 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  28.63 
 
 
370 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  34.21 
 
 
405 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  27.25 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  28.3 
 
 
390 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  26.25 
 
 
375 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.48 
 
 
341 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  24.68 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  26.64 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  28.38 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  29.73 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  26.03 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  40.91 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  25.96 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.73 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  25.31 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  28.2 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  26.45 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  29.79 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  30.57 
 
 
320 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  26.54 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  28.95 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  25.36 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  24.22 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  31.16 
 
 
589 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  29.67 
 
 
390 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>