64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0064 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  759    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  38.85 
 
 		 375 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  38.01 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  38.01 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  30.11 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  28.69 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  28.98 
 
 		 354 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  30.06 
 
 		 374 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  28.1 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  29.93 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  28.71 
 
 		 386 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  29.22 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  28.92 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  27.06 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  28.66 
 
 		 617 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  28.92 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  27.73 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  28.78 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  28.04 
 
 		 539 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  25.21 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  28.33 
 
 		 379 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  30.65 
 
 		 650 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  30.48 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  27.52 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  27.81 
 
 		 341 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.18 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  27.88 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  35.48 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  28.66 
 
 		 396 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.61 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  31.58 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  25.36 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  26.57 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  25.36 
 
 		 375 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  32.32 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  24.38 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  31.31 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  35.17 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  29.32 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  24.73 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  26.04 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  31.1 
 
 		 638 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  32.16 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  31.18 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  27.89 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  31.61 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  25.59 
 
 		 343 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  32.52 
 
 		 589 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  31.61 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  36.11 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  27.22 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  26.99 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  32.35 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  29.81 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  29.93 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  30.95 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  25.5 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  30.38 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  31.65 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  27.68 
 
 		 135 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  27.49 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  34.52 
 
 		 568 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>