88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4216 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  803    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  46.15 
 
 
390 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  45.89 
 
 
402 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  48.18 
 
 
392 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  34.33 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  32.14 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  29.07 
 
 
341 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  33.87 
 
 
422 aa  126  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  29.08 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  30.31 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  31.25 
 
 
397 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 
389 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.67 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.67 
 
 
375 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  27.37 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  25.28 
 
 
349 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  27.81 
 
 
406 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  27.78 
 
 
345 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  30.36 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  26.16 
 
 
370 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  26.34 
 
 
539 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  30.84 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  24.8 
 
 
368 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  27.55 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  28.74 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  24.25 
 
 
617 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  28.74 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  32.16 
 
 
371 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  29.05 
 
 
638 aa  76.6  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  26.69 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  23.46 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.3 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  26.3 
 
 
458 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  27.98 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  28.49 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  27.23 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  24.76 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.01 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  27.52 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  27.66 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  26.92 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  23.75 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  23.93 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  42.11 
 
 
159 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.91 
 
 
760 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  26.15 
 
 
705 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  23.93 
 
 
375 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.98 
 
 
548 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.2 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  39.13 
 
 
390 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  23.86 
 
 
349 aa  57  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  38.81 
 
 
388 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  24.55 
 
 
657 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  33.33 
 
 
575 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  34.04 
 
 
344 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  25.1 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.2 
 
 
555 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  23.91 
 
 
589 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  29.21 
 
 
754 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  29.21 
 
 
754 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  29.79 
 
 
575 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  36.47 
 
 
343 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  21.67 
 
 
365 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  26.26 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  26.26 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  28.74 
 
 
330 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  30.77 
 
 
570 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  25.11 
 
 
764 aa  49.7  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  29.67 
 
 
584 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  41.94 
 
 
320 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.56 
 
 
753 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  24.02 
 
 
353 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.97 
 
 
522 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  25.81 
 
 
589 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  31.62 
 
 
564 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.27 
 
 
756 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  24.7 
 
 
593 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  37.5 
 
 
689 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  25.25 
 
 
539 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  25.58 
 
 
603 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  23.67 
 
 
596 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  26.92 
 
 
598 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  21.8 
 
 
599 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  32.91 
 
 
578 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  27.69 
 
 
363 aa  43.1  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  32.53 
 
 
135 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>