53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0789 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  100 
 
 
555 aa  1141    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  48.89 
 
 
548 aa  511  1e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  47.96 
 
 
705 aa  460  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  27.71 
 
 
522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  22.83 
 
 
593 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  25.77 
 
 
615 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  23.79 
 
 
690 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  24.36 
 
 
598 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  23.24 
 
 
588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  24.14 
 
 
754 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  24.14 
 
 
754 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  25.18 
 
 
657 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  24.49 
 
 
760 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  23.38 
 
 
617 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  25.46 
 
 
764 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  24.75 
 
 
635 aa  104  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  24.13 
 
 
641 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  24.36 
 
 
589 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  24.5 
 
 
640 aa  98.6  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  23.55 
 
 
570 aa  97.8  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  22.15 
 
 
778 aa  97.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  26.02 
 
 
576 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  24.93 
 
 
546 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  25.34 
 
 
756 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  24.7 
 
 
584 aa  93.6  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  24 
 
 
575 aa  93.6  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.43 
 
 
582 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  32.09 
 
 
596 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  21.77 
 
 
753 aa  87.4  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  25.82 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  25.99 
 
 
570 aa  74.7  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  29.11 
 
 
603 aa  74.3  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.59 
 
 
221 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  23.33 
 
 
599 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.59 
 
 
221 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  26.32 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  38.61 
 
 
575 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  24.5 
 
 
593 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  23.17 
 
 
608 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  37.86 
 
 
581 aa  63.9  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  26.45 
 
 
598 aa  57.8  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  26.92 
 
 
343 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  25.91 
 
 
402 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  27.83 
 
 
137 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  33.67 
 
 
751 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  27.17 
 
 
344 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  43.64 
 
 
89 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  24.88 
 
 
390 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  23.64 
 
 
330 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  25.24 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  25 
 
 
470 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28.66 
 
 
353 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>