39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3288 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 599 aa  1226    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  35.95 
 
 		 608 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  33.44 
 
 		 593 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  28.88 
 
 		 581 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  29 
 
 		 576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  31.41 
 
 		 472 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  26.18 
 
 		 563 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  22.6 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  22.6 
 
 		 754 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  26.74 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  20.41 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  20.55 
 
 		 570 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  26.37 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.75 
 
 		 760 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  26.82 
 
 		 756 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  23.8 
 
 		 570 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.54 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.1 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.33 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  20.16 
 
 		 657 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.52 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  20.87 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  25.64 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  25.64 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  20.11 
 
 		 751 aa  57.4  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  38.36 
 
 		 89 aa  54.3  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5121  hypothetical protein  55.32 
 
 		 72 aa  53.9  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.910075  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  21.37 
 
 		 588 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  19.75 
 
 		 575 aa  51.2  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  30.17 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  21.09 
 
 		 603 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  24.79 
 
 		 596 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  32.69 
 
 		 640 aa  48.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  26.67 
 
 		 778 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  25.83 
 
 		 690 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  39.02 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  34 
 
 		 598 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  29.41 
 
 		 641 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  26.89 
 
 		 615 aa  44.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>