64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3084 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1590    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  47.32 
 
 		 588 aa  532  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  43.79 
 
 		 598 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  44.92 
 
 		 592 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  45.97 
 
 		 615 aa  479  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  44.25 
 
 		 593 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  42.53 
 
 		 617 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  41.85 
 
 		 635 aa  465  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  40.23 
 
 		 641 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  39.74 
 
 		 640 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.78 
 
 		 705 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  24.88 
 
 		 756 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  25.95 
 
 		 764 aa  160  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  26.15 
 
 		 582 aa  157  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  26.93 
 
 		 760 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 313 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.16 
 
 		 548 aa  107  7e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  23.83 
 
 		 598 aa  105  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  22.15 
 
 		 555 aa  94  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.38 
 
 		 753 aa  93.2  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  22.54 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  29.7 
 
 		 632 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  36.84 
 
 		 277 aa  89  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  34.15 
 
 		 382 aa  88.6  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  31.1 
 
 		 492 aa  88.2  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.06 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  23.4 
 
 		 575 aa  79  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  34.97 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.64 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  35.16 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  62.5 
 
 		 74 aa  73.2  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  37.11 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  37.11 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  41.67 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  34.68 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  31.3 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  36.13 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  22.4 
 
 		 221 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  22.4 
 
 		 221 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 499 aa  54.3  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  35.05 
 
 		 576 aa  52  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  32.04 
 
 		 546 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  58.54 
 
 		 60 aa  50.4  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 596 aa  50.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  27.11 
 
 		 570 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  26.87 
 
 		 563 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  31.97 
 
 		 548 aa  47.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  23.31 
 
 		 390 aa  47.8  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  27.85 
 
 		 751 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  47  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  27.61 
 
 		 209 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  29.69 
 
 		 646 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  27.84 
 
 		 603 aa  45.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 430 aa  45.4  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  32.58 
 
 		 593 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  24.63 
 
 		 689 aa  44.7  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  27.82 
 
 		 568 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 556 aa  44.3  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 458 aa  44.3  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  32.67 
 
 		 656 aa  44.3  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  25.49 
 
 		 577 aa  44.3  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>