36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2482 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1549    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  27.65 
 
 
608 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  20.43 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  33.98 
 
 
576 aa  64.7  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  34.29 
 
 
760 aa  63.9  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  31.62 
 
 
581 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  38.54 
 
 
575 aa  63.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  30 
 
 
596 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  31.93 
 
 
570 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  37.89 
 
 
575 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  36.19 
 
 
753 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  33 
 
 
754 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  33 
 
 
754 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  20.11 
 
 
599 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.73 
 
 
756 aa  57.4  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  35.56 
 
 
522 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  35.79 
 
 
603 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  31.31 
 
 
705 aa  55.8  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  32.26 
 
 
570 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  20.94 
 
 
563 aa  54.7  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  32.69 
 
 
640 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  30.63 
 
 
764 aa  54.3  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  31.73 
 
 
641 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  30.53 
 
 
584 aa  53.9  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  33.67 
 
 
555 aa  53.1  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  30.61 
 
 
589 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 
548 aa  51.6  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  26.92 
 
 
635 aa  50.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  28.09 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  28.09 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  40.74 
 
 
89 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  29.63 
 
 
582 aa  48.9  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  29.69 
 
 
249 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  27.85 
 
 
778 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  32.22 
 
 
657 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.03 
 
 
546 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>