23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0289 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  38.55 
 
 		 522 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  29.69 
 
 		 751 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  32.47 
 
 		 617 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  29 
 
 		 641 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  32.14 
 
 		 593 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  27.66 
 
 		 548 aa  45.8  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  28 
 
 		 640 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  27.36 
 
 		 615 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  30.26 
 
 		 596 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 778 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  32.26 
 
 		 344 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  32.22 
 
 		 581 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.5 
 
 		 705 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.26 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.39 
 
 		 756 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 575 aa  42.4  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.78 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.78 
 
 		 221 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  31.4 
 
 		 608 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 760 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  34.85 
 
 		 422 aa  42  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>