44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2248 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1310    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  49.84 
 
 
641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  49.84 
 
 
640 aa  595  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  47.99 
 
 
588 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  46.67 
 
 
615 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  45.82 
 
 
593 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  45.11 
 
 
592 aa  505  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  43.85 
 
 
617 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  42.09 
 
 
598 aa  477  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  41.85 
 
 
778 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2679  hypothetical protein  85.19 
 
 
81 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.353369  normal  0.0921566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  24.5 
 
 
522 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.42 
 
 
582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.63 
 
 
548 aa  97.8  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  22.62 
 
 
598 aa  97.1  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.54 
 
 
690 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  24.52 
 
 
756 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  37.5 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  24 
 
 
705 aa  67.8  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  25.82 
 
 
555 aa  67  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  54.1 
 
 
74 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  42.05 
 
 
753 aa  65.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  35 
 
 
137 aa  63.9  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  41.57 
 
 
760 aa  63.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  26.15 
 
 
570 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  23.7 
 
 
584 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  25.77 
 
 
575 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  31.62 
 
 
589 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  35.96 
 
 
754 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  35.96 
 
 
754 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  37.5 
 
 
657 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  23.27 
 
 
221 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  23.27 
 
 
221 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  35.19 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  57.14 
 
 
60 aa  52.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  26.92 
 
 
751 aa  50.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  29.73 
 
 
596 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  34.69 
 
 
546 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  30.1 
 
 
576 aa  47.4  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  28.26 
 
 
344 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  28.26 
 
 
343 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  28.3 
 
 
563 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  24.81 
 
 
593 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  24.07 
 
 
603 aa  44.3  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>