54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1971 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 596 aa  1227    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  44.5 
 
 		 603 aa  521  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  31.18 
 
 		 589 aa  310  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  31.28 
 
 		 584 aa  273  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  30.77 
 
 		 756 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  28.36 
 
 		 764 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  26.36 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  26.36 
 
 		 754 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  24.96 
 
 		 570 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  43.1 
 
 		 128 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  30.5 
 
 		 575 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  29.93 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  24.4 
 
 		 592 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  41.74 
 
 		 118 aa  97.8  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  33.04 
 
 		 760 aa  96.3  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  30.49 
 
 		 657 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  31.36 
 
 		 753 aa  88.2  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  32.09 
 
 		 555 aa  88.2  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  45.98 
 
 		 89 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  25 
 
 		 640 aa  68.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  27.86 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  33.66 
 
 		 548 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  25.99 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  25.99 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  22.79 
 
 		 641 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  38.89 
 
 		 705 aa  63.5  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  36.36 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  30 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  23.95 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  25.2 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  28.09 
 
 		 617 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  23.72 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 		 588 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  21.05 
 
 		 598 aa  54.3  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  20.73 
 
 		 582 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  27.81 
 
 		 598 aa  53.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  20.95 
 
 		 690 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  29.25 
 
 		 581 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 778 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  29.73 
 
 		 635 aa  49.3  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  21.92 
 
 		 539 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 		 576 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  27.68 
 
 		 593 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  24.79 
 
 		 599 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  32.76 
 
 		 89 aa  47.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  29.35 
 
 		 344 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  29.35 
 
 		 343 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  21.35 
 
 		 563 aa  47  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  30.1 
 
 		 377 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  31.51 
 
 		 178 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  35.14 
 
 		 499 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  45.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  30.26 
 
 		 249 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  21.59 
 
 		 490 aa  43.5  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>