45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6163 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 593 aa  1228    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  58.31 
 
 		 592 aa  670    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  49.49 
 
 		 615 aa  558  1e-157  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  48.14 
 
 		 588 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  44.33 
 
 		 598 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  45.82 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  44.25 
 
 		 778 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  43.03 
 
 		 641 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  41.05 
 
 		 617 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  42.76 
 
 		 640 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  28.18 
 
 		 582 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.23 
 
 		 548 aa  140  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  22 
 
 		 555 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  22.96 
 
 		 705 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  25.41 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  25.42 
 
 		 760 aa  93.6  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  22.01 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  22.01 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  24.67 
 
 		 753 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  23.64 
 
 		 756 aa  79.7  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.02 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  22.77 
 
 		 764 aa  71.2  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  22.55 
 
 		 570 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  25.97 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  26.45 
 
 		 589 aa  67  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  34.56 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  20.87 
 
 		 690 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  40.96 
 
 		 575 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  37.21 
 
 		 657 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  49.12 
 
 		 74 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  22.31 
 
 		 221 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  22.31 
 
 		 221 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0648  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  54.3  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0256019  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  24.2 
 
 		 603 aa  50.8  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1414  hypothetical protein  38.3 
 
 		 89 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314022  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  30.58 
 
 		 563 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  27.68 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  36.71 
 
 		 330 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  27.66 
 
 		 402 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  23.32 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  31.52 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1401  hypothetical protein  36.17 
 
 		 118 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.174076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.85 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  37.21 
 
 		 576 aa  44.3  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>