28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1685 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1184    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  57.66 
 
 
582 aa  483  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  23.11 
 
 
592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  24.28 
 
 
588 aa  110  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  25.41 
 
 
593 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  23.83 
 
 
778 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  24.47 
 
 
617 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  22.62 
 
 
635 aa  97.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  21.38 
 
 
615 aa  91.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  25.89 
 
 
690 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  23.89 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  21.28 
 
 
640 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  20.46 
 
 
641 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  25.79 
 
 
657 aa  63.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  24.01 
 
 
589 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  22.68 
 
 
754 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  22.68 
 
 
754 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.53 
 
 
705 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2394  hypothetical protein  28.47 
 
 
385 aa  54.7  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  19.47 
 
 
522 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  27.81 
 
 
596 aa  53.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  22.92 
 
 
575 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  22.6 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  28.16 
 
 
555 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.68 
 
 
760 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  22.08 
 
 
603 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  19.5 
 
 
570 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>