48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1684 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  66.42 
 
 		 582 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  35.16 
 
 		 778 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 588 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  34.56 
 
 		 593 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  33.33 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  35 
 
 		 635 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  30.89 
 
 		 598 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  28.69 
 
 		 570 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  37.5 
 
 		 548 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  35.35 
 
 		 705 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  33.04 
 
 		 575 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  38.14 
 
 		 592 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  30.25 
 
 		 690 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  31.11 
 
 		 641 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  32.63 
 
 		 617 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  32.63 
 
 		 589 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  30.33 
 
 		 575 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  27.83 
 
 		 555 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  36.47 
 
 		 584 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  30.77 
 
 		 764 aa  51.6  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  32.14 
 
 		 754 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  32.14 
 
 		 754 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  29.2 
 
 		 640 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  31.3 
 
 		 593 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  32.97 
 
 		 657 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  28.26 
 
 		 753 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  32.29 
 
 		 756 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  33.04 
 
 		 330 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  28.28 
 
 		 563 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  26.83 
 
 		 760 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  31.52 
 
 		 522 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  26.17 
 
 		 596 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  37.11 
 
 		 581 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  37.5 
 
 		 576 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  29.21 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  29.21 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  36.25 
 
 		 656 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  31.58 
 
 		 780 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  26.83 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 751 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  25 
 
 		 573 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  26.83 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  31.63 
 
 		 603 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  32.5 
 
 		 585 aa  40.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  35.37 
 
 		 344 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  35.37 
 
 		 343 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  31.76 
 
 		 249 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>