47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2961 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  100 
 
 
598 aa  1246    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  47.95 
 
 
588 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  47.99 
 
 
615 aa  563  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  42.78 
 
 
592 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  44.33 
 
 
593 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  43.79 
 
 
778 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  42.18 
 
 
641 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  41.44 
 
 
640 aa  480  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  42.09 
 
 
635 aa  477  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  42.95 
 
 
617 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  27.21 
 
 
582 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  23.8 
 
 
522 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  24.44 
 
 
548 aa  123  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.36 
 
 
555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  22.96 
 
 
754 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  22.96 
 
 
754 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  21.84 
 
 
705 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  22.62 
 
 
760 aa  87.4  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  21.08 
 
 
584 aa  84.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  23.89 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  21.63 
 
 
690 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  22.13 
 
 
756 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  60 
 
 
74 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  22.26 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  21.6 
 
 
764 aa  70.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  25.29 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  30.89 
 
 
137 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  35.19 
 
 
570 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  35.56 
 
 
753 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  58.14 
 
 
60 aa  57.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  34.41 
 
 
575 aa  55.1  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  21.05 
 
 
596 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  38.16 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  24.51 
 
 
221 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  24.51 
 
 
221 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.1 
 
 
390 aa  50.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  29.03 
 
 
563 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  29.29 
 
 
593 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  28.36 
 
 
576 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  26.92 
 
 
402 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  28.1 
 
 
603 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  34 
 
 
599 aa  46.2  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  21.74 
 
 
600 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  23.9 
 
 
619 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  30.25 
 
 
608 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  27.34 
 
 
344 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  28.06 
 
 
343 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>