45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1845 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  90.33 
 
 		 640 aa  1200    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1320    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  49.84 
 
 		 635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  44.77 
 
 		 588 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  42.18 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  41.72 
 
 		 617 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  43.18 
 
 		 615 aa  488  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  43.03 
 
 		 593 aa  469  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  42.5 
 
 		 592 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  40.23 
 
 		 778 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  24.56 
 
 		 582 aa  142  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  25.2 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  22.76 
 
 		 548 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.42 
 
 		 555 aa  94.4  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  61.9 
 
 		 74 aa  84.3  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  23.37 
 
 		 570 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  20.81 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  20.46 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  43.33 
 
 		 760 aa  73.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  22.24 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  21.97 
 
 		 756 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  40 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  40 
 
 		 754 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  21.13 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  22.2 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  22.79 
 
 		 596 aa  63.9  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  40 
 
 		 753 aa  63.9  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  21.61 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  21.34 
 
 		 690 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  35.05 
 
 		 764 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  31.52 
 
 		 657 aa  57  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  23.2 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  23.2 
 
 		 221 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  31.73 
 
 		 751 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  28.32 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  28.87 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  25.93 
 
 		 593 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  29 
 
 		 249 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  22.13 
 
 		 390 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  26.73 
 
 		 603 aa  46.2  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  47.62 
 
 		 60 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  31.13 
 
 		 576 aa  45.8  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  29.41 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  25.69 
 
 		 353 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>