69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0645 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  35.05 
 
 		 343 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  33.73 
 
 		 344 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  29.21 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  31.79 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  28.51 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  29.47 
 
 		 650 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  28.42 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  25.24 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  27.46 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  26.78 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  26.45 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  25.95 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  28.43 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.21 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.32 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  27.78 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  27.43 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28.08 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  26.88 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  28.86 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.49 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  23.96 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  26.32 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  27.27 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  29.17 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  25.5 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  23.62 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  25.4 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  23.93 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  31.14 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  26.36 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  24.03 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  28.26 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  28.26 
 
 		 754 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  26.09 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  27.22 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  27.22 
 
 		 375 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  23.53 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  25.49 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  34.74 
 
 		 582 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  27.27 
 
 		 458 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  28.41 
 
 		 159 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  34.09 
 
 		 603 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  27.78 
 
 		 178 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  23.38 
 
 		 375 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  23.97 
 
 		 705 aa  49.3  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  23.13 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  23.17 
 
 		 555 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  24.18 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  35.48 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  26.76 
 
 		 363 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  23.62 
 
 		 760 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  33.04 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  36.71 
 
 		 593 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  36.99 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  22.7 
 
 		 406 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  30.16 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  36.92 
 
 		 593 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  31.17 
 
 		 548 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  30.59 
 
 		 764 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  23.9 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  20.74 
 
 		 366 aa  43.1  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  30.3 
 
 		 402 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>