97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2938 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1017    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  34.79 
 
 
470 aa  259  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  34.78 
 
 
471 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  32.5 
 
 
458 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  26.76 
 
 
432 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  31.65 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  25.74 
 
 
491 aa  89  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  23.62 
 
 
498 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  32.31 
 
 
646 aa  77.4  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  26.21 
 
 
573 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  25.81 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  26.52 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  41.86 
 
 
692 aa  68.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  25.56 
 
 
649 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  24.63 
 
 
606 aa  68.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  38.95 
 
 
591 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  25.86 
 
 
555 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  27.27 
 
 
529 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  47.06 
 
 
593 aa  63.9  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  25.46 
 
 
585 aa  63.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  26.67 
 
 
550 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
600 aa  63.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  25.17 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  25.17 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  27.27 
 
 
593 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  33.7 
 
 
539 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  38.67 
 
 
680 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  27.27 
 
 
723 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  30.81 
 
 
577 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  27.39 
 
 
687 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  35.29 
 
 
563 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25 
 
 
842 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  41.54 
 
 
619 aa  58.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  41.3 
 
 
552 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.03 
 
 
584 aa  57  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  24.03 
 
 
584 aa  57  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  23.81 
 
 
689 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  34 
 
 
568 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  25.23 
 
 
663 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  41.38 
 
 
588 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  42.19 
 
 
82 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  26 
 
 
659 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  41.46 
 
 
700 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  32.95 
 
 
559 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  39.73 
 
 
573 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  26.03 
 
 
664 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  25.35 
 
 
596 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  37.66 
 
 
602 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  36.62 
 
 
722 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  33.33 
 
 
780 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.1 
 
 
656 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  34.12 
 
 
704 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0809  hypothetical protein  26.73 
 
 
570 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.71 
 
 
699 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  33.33 
 
 
564 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  32.58 
 
 
590 aa  52  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  37.8 
 
 
726 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  35.71 
 
 
697 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  36.76 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  35.71 
 
 
697 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  41.49 
 
 
600 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.89 
 
 
699 aa  50.4  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  29.57 
 
 
615 aa  50.4  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  23.55 
 
 
656 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.97 
 
 
555 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 
785 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  36.23 
 
 
490 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  38.46 
 
 
690 aa  49.3  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  42.47 
 
 
689 aa  48.5  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  36.73 
 
 
578 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  30.38 
 
 
582 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  38.96 
 
 
709 aa  47.8  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  34 
 
 
695 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  39.71 
 
 
322 aa  47.4  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0247  hypothetical protein  32.69 
 
 
714 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  26.99 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  36.11 
 
 
835 aa  46.6  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  30.77 
 
 
571 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 
576 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  22.08 
 
 
612 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  37.63 
 
 
629 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  32.84 
 
 
569 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  35.14 
 
 
596 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  24.73 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  32.91 
 
 
561 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  32.97 
 
 
570 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8679  hypothetical protein  34.21 
 
 
816 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  31.87 
 
 
619 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  40.58 
 
 
601 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  26.26 
 
 
580 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  26.79 
 
 
779 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  26.79 
 
 
779 aa  43.9  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  29.63 
 
 
657 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.23 
 
 
394 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.19 
 
 
772 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.07 
 
 
641 aa  43.5  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>