34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_1065 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  37.66 
 
 		 168 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0465  hypothetical protein  29.13 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.559126  normal  0.33995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  26.77 
 
 		 367 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  25.84 
 
 		 369 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 375 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 		 344 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.78 
 
 		 330 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 548 aa  49.3  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  32.5 
 
 		 764 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 		 343 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  28.72 
 
 		 353 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  31.51 
 
 		 596 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  31.25 
 
 		 603 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  27.48 
 
 		 650 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  24.29 
 
 		 422 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 360 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  31.25 
 
 		 705 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  30.38 
 
 		 756 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  39.71 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  30 
 
 		 589 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  21.65 
 
 		 394 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  32.84 
 
 		 349 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  23.08 
 
 		 638 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  29.17 
 
 		 320 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  34.25 
 
 		 365 aa  42.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  28.4 
 
 		 570 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  34.62 
 
 		 760 aa  41.6  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  30.26 
 
 		 399 aa  41.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  27.85 
 
 		 555 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  24.41 
 
 		 391 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>