23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4780 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4780  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  343  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0465  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  131  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.559126  normal  0.33995 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  37.66 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  32.7 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  32.91 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  26.36 
 
 		 369 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  28.39 
 
 		 391 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  26.04 
 
 		 399 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  25.71 
 
 		 341 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  25.58 
 
 		 638 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  26.21 
 
 		 397 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  26.15 
 
 		 366 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  32.93 
 
 		 596 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  27.74 
 
 		 375 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.99 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  26.76 
 
 		 365 aa  42  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  34.78 
 
 		 370 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  34.78 
 
 		 370 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  32.14 
 
 		 320 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  25.75 
 
 		 368 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  25.69 
 
 		 409 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  22.95 
 
 		 343 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  28.28 
 
 		 422 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>