34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3234 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3234  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
570 aa  1179    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.926353  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  26.22 
 
 
576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  28.11 
 
 
608 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  24.5 
 
 
754 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  24.5 
 
 
754 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  26.59 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  26 
 
 
760 aa  68.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  23.8 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0874  hypothetical protein  23.97 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.798242  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  21.37 
 
 
548 aa  67  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  27.14 
 
 
570 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9526  hypothetical protein  22.55 
 
 
581 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  27.82 
 
 
588 aa  64.3  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  34.71 
 
 
575 aa  63.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  38.71 
 
 
575 aa  61.6  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  22.91 
 
 
657 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  25.31 
 
 
753 aa  60.1  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  24.34 
 
 
563 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  33.93 
 
 
756 aa  58.9  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  26.84 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0875  hypothetical protein  35.53 
 
 
89 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242342  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  24 
 
 
705 aa  58.2  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  32.26 
 
 
751 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  27.56 
 
 
584 aa  55.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  26.75 
 
 
221 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  26.75 
 
 
221 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  21.49 
 
 
522 aa  53.9  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  24.39 
 
 
582 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  22.22 
 
 
593 aa  51.6  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  27.11 
 
 
778 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  21.73 
 
 
592 aa  48.5  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  30.28 
 
 
764 aa  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  23.08 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  31.96 
 
 
615 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>