66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3189 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0564  hypothetical protein  60.08 
 
 		 504 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.755546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1177    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  31.84 
 
 		 588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  23.71 
 
 		 619 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  24.29 
 
 		 559 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  20.65 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  22.93 
 
 		 574 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  19.48 
 
 		 584 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.71 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  24.35 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  22.57 
 
 		 687 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  19.9 
 
 		 584 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.24 
 
 		 555 aa  62  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  31.5 
 
 		 692 aa  62  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.63 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  23.92 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  40.86 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  36.99 
 
 		 458 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  22.36 
 
 		 680 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  40.23 
 
 		 172 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  22.02 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  25.09 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  20.68 
 
 		 569 aa  55.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.3 
 
 		 573 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  25.2 
 
 		 600 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  24.17 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  24.17 
 
 		 465 aa  54.7  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  34.83 
 
 		 562 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  34.83 
 
 		 562 aa  54.7  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  35.48 
 
 		 552 aa  54.7  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  23.55 
 
 		 695 aa  53.5  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  31.33 
 
 		 529 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  26.88 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  26.29 
 
 		 842 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  30 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.08 
 
 		 726 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  20.03 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  31.52 
 
 		 499 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  23.26 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  33.64 
 
 		 722 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  26.27 
 
 		 561 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  25 
 
 		 590 aa  51.2  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  27.03 
 
 		 555 aa  51.2  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  28.12 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  35.59 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  31.3 
 
 		 690 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  29.41 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  21.59 
 
 		 568 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  32.93 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  20.75 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  25.15 
 
 		 432 aa  49.7  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.39 
 
 		 526 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  34.07 
 
 		 606 aa  48.5  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  21.69 
 
 		 656 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  29.35 
 
 		 785 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  32.37 
 
 		 223 aa  48.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  31.03 
 
 		 593 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  34.18 
 
 		 689 aa  48.1  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  26.23 
 
 		 578 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.91 
 
 		 700 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  25 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  21.54 
 
 		 697 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  32.93 
 
 		 659 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  29.55 
 
 		 602 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  23.81 
 
 		 646 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  29.17 
 
 		 707 aa  43.5  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>