26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0632 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0632  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432592  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  37.14 
 
 
386 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  36.73 
 
 
353 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  34.86 
 
 
345 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  34.91 
 
 
370 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  31.58 
 
 
458 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  33.03 
 
 
349 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  39.56 
 
 
650 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  34.31 
 
 
369 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  31.19 
 
 
470 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  35.05 
 
 
367 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  27.68 
 
 
371 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  30.61 
 
 
617 aa  47.4  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.57 
 
 
366 aa  47  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.87 
 
 
539 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.03 
 
 
375 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  34.88 
 
 
402 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  36.05 
 
 
365 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  34.38 
 
 
390 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
406 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  30.12 
 
 
390 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  27.35 
 
 
389 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  26.9 
 
 
374 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  31.18 
 
 
638 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  29.03 
 
 
354 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>