41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4280 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  797    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  45.57 
 
 
390 aa  324  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  32.68 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  31.68 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  26.26 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.95 
 
 
470 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  25.35 
 
 
650 aa  57.4  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  38.81 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  43.33 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  29.55 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  29.55 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  27.85 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  31.65 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  40 
 
 
390 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  33.01 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  30.95 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  34.29 
 
 
353 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  27.46 
 
 
221 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  27.46 
 
 
221 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  38.03 
 
 
396 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  39.68 
 
 
370 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  42.19 
 
 
406 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  28.75 
 
 
399 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  26.32 
 
 
375 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  22.92 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  29.91 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 
159 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  30.23 
 
 
379 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  25.95 
 
 
589 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  24.05 
 
 
375 aa  46.6  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  35.82 
 
 
343 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  28.38 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  27.1 
 
 
638 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  31.08 
 
 
539 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.76 
 
 
375 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  24.1 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  29.89 
 
 
760 aa  43.1  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  33.33 
 
 
422 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>