76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003236 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  88.3 
 
 		 470 aa  875    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  980    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  52.33 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  34.78 
 
 		 499 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  27.07 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  31.78 
 
 		 451 aa  98.2  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  24.32 
 
 		 491 aa  90.1  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  23.57 
 
 		 498 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  25.72 
 
 		 646 aa  75.5  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  36.03 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  25.42 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.16 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  42.03 
 
 		 563 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  32.74 
 
 		 588 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  27.12 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  40 
 
 		 709 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  25.09 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  27.08 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  27.08 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  37.21 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  25.57 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  33.62 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  22.98 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  22.98 
 
 		 465 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.48 
 
 		 842 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.14 
 
 		 584 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  24.14 
 
 		 584 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  24.46 
 
 		 687 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  32.98 
 
 		 573 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  32.97 
 
 		 591 aa  53.5  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  30.63 
 
 		 577 aa  53.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  30.48 
 
 		 779 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  30.48 
 
 		 779 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25.39 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  34.09 
 
 		 550 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  31.58 
 
 		 722 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  23.74 
 
 		 663 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  33.8 
 
 		 593 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  32.43 
 
 		 552 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  25.99 
 
 		 723 aa  50.1  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  25.11 
 
 		 659 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  39.13 
 
 		 690 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  40 
 
 		 552 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.9 
 
 		 772 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  34.78 
 
 		 490 aa  48.5  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  33.8 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  37.08 
 
 		 609 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  38.46 
 
 		 692 aa  47.8  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  33.72 
 
 		 539 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  32.39 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.49 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  39.44 
 
 		 578 aa  46.2  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 606 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  31.43 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  29.11 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  35.06 
 
 		 559 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  25 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  37.18 
 
 		 726 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.96 
 
 		 555 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  34.62 
 
 		 704 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  32.94 
 
 		 697 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  34.21 
 
 		 353 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  36.05 
 
 		 590 aa  44.3  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  32.94 
 
 		 697 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.52 
 
 		 699 aa  44.3  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 785 aa  43.9  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  33.05 
 
 		 601 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  34.62 
 
 		 571 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.26 
 
 		 631 aa  43.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  31.94 
 
 		 569 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  31.65 
 
 		 564 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  35.96 
 
 		 699 aa  43.1  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>