19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4260 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4260  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  30.25 
 
 
369 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28.3 
 
 
367 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  26.25 
 
 
391 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  25.5 
 
 
394 aa  62  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4256  hypothetical protein  29.69 
 
 
130 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  26.9 
 
 
366 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  26.62 
 
 
396 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  32.53 
 
 
370 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  27.89 
 
 
378 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  20.98 
 
 
353 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  25 
 
 
354 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  25 
 
 
638 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  26.72 
 
 
650 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  25.68 
 
 
341 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  25.56 
 
 
389 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  24.64 
 
 
365 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  28.03 
 
 
379 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  25.69 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>