109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4594 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  60.62 
 
 		 699 aa  869    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  58.45 
 
 		 699 aa  866    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  63.46 
 
 		 704 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  61.9 
 
 		 697 aa  880    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  61.7 
 
 		 697 aa  879    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 707 aa  1464    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  55.18 
 
 		 695 aa  807    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  49.49 
 
 		 722 aa  552  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  34.96 
 
 		 687 aa  359  8e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  34.75 
 
 		 690 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  32.58 
 
 		 692 aa  296  7e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  32.81 
 
 		 656 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  33.51 
 
 		 659 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.16 
 
 		 689 aa  260  6e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  31.81 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  30.66 
 
 		 842 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.84 
 
 		 772 aa  219  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.98 
 
 		 700 aa  196  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  28.96 
 
 		 590 aa  163  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.48 
 
 		 631 aa  150  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  26.37 
 
 		 621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  27.43 
 
 		 609 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  26.94 
 
 		 695 aa  127  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.32 
 
 		 726 aa  125  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  33.2 
 
 		 353 aa  124  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.92 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.86 
 
 		 600 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  29.31 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.57 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  25.38 
 
 		 559 aa  115  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  25.98 
 
 		 555 aa  114  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  24.53 
 
 		 552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  26.71 
 
 		 785 aa  110  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  23.25 
 
 		 552 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  23.39 
 
 		 669 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  24.78 
 
 		 696 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  23.68 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  24.37 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.53 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  23.63 
 
 		 569 aa  102  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  23.52 
 
 		 561 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  23.66 
 
 		 629 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  25.09 
 
 		 526 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  23.4 
 
 		 573 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  22.79 
 
 		 539 aa  99.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  24.83 
 
 		 582 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  24.72 
 
 		 584 aa  95.5  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.88 
 
 		 584 aa  95.1  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  24.96 
 
 		 574 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  23.93 
 
 		 571 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.09 
 
 		 529 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  25.42 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  34.75 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  34.35 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  22.7 
 
 		 593 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  25.62 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  25.62 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  25.56 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  25 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  31.01 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  33.04 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  41.35 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  34.11 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  30.51 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  30.51 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  24.64 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  24.71 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  31.93 
 
 		 723 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.58 
 
 		 585 aa  70.5  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  22.99 
 
 		 568 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  22.72 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  25.81 
 
 		 835 aa  66.6  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  24.56 
 
 		 593 aa  64.7  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  28 
 
 		 646 aa  64.7  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.46 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  35.48 
 
 		 372 aa  63.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  35.77 
 
 		 329 aa  63.9  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  25.59 
 
 		 606 aa  60.1  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  24.88 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  31.45 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  36.67 
 
 		 172 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  23.21 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  25.29 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  29.69 
 
 		 580 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  30.7 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  30.37 
 
 		 573 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  32 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  33.87 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  33.87 
 
 		 306 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  33.87 
 
 		 306 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.64 
 
 		 600 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  39.51 
 
 		 223 aa  52  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  27.5 
 
 		 663 aa  51.6  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  28.51 
 
 		 664 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  29.69 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  35.87 
 
 		 780 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  29.92 
 
 		 309 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  33.11 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  26.07 
 
 		 709 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>