26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0038 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  598  1e-170  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  92.12 
 
 
292 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  35.6 
 
 
312 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  35.53 
 
 
304 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  35.26 
 
 
342 aa  192  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  34.67 
 
 
305 aa  185  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  34.75 
 
 
309 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  34.87 
 
 
309 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  32.89 
 
 
306 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  32.79 
 
 
306 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  32.79 
 
 
306 aa  168  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  32.69 
 
 
329 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  32.89 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  31.13 
 
 
322 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  33.22 
 
 
305 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  32.74 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.61 
 
 
699 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  40.52 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  28.89 
 
 
584 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.51 
 
 
699 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  31.01 
 
 
707 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  34 
 
 
697 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  34 
 
 
697 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 
695 aa  75.5  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  31 
 
 
704 aa  72.4  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  30.77 
 
 
372 aa  58.9  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>