107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2940 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  100 
 
 
772 aa  1551    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  44.04 
 
 
842 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  33.45 
 
 
659 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  33.68 
 
 
656 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  31.49 
 
 
656 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  46.75 
 
 
353 aa  280  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.57 
 
 
699 aa  251  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  29.69 
 
 
697 aa  245  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  28.69 
 
 
695 aa  243  7e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  29.69 
 
 
697 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
687 aa  230  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  28.84 
 
 
704 aa  226  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  30.78 
 
 
722 aa  226  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.91 
 
 
699 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  29.68 
 
 
707 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  28.11 
 
 
692 aa  205  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  26.94 
 
 
689 aa  201  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  27.82 
 
 
690 aa  194  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.96 
 
 
700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.06 
 
 
631 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  28.67 
 
 
785 aa  164  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.12 
 
 
641 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  27.07 
 
 
609 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  26.39 
 
 
621 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  26.61 
 
 
656 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  28.4 
 
 
590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  25.3 
 
 
669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  26.87 
 
 
695 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  24.78 
 
 
696 aa  127  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  22.96 
 
 
600 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  25.6 
 
 
552 aa  123  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  24.8 
 
 
629 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  26.27 
 
 
559 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  22.96 
 
 
539 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.27 
 
 
550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  23.6 
 
 
584 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23.68 
 
 
584 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.45 
 
 
726 aa  111  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.37 
 
 
573 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  23.77 
 
 
569 aa  110  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  23.92 
 
 
561 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  23.37 
 
 
573 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  44.76 
 
 
161 aa  107  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  21.98 
 
 
552 aa  104  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  25.17 
 
 
571 aa  104  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  25.44 
 
 
526 aa  104  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  23.67 
 
 
578 aa  97.4  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.5 
 
 
585 aa  95.1  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  20.27 
 
 
529 aa  92.4  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  25.29 
 
 
574 aa  92  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  24.96 
 
 
573 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  27.17 
 
 
591 aa  89  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  28.63 
 
 
582 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.68 
 
 
555 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  22.24 
 
 
568 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  22.2 
 
 
596 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  21.59 
 
 
593 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  24.77 
 
 
680 aa  75.9  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.71 
 
 
729 aa  75.5  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  27.11 
 
 
723 aa  74.7  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 
555 aa  72  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  26.77 
 
 
689 aa  71.2  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  23.58 
 
 
606 aa  70.1  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.73 
 
 
600 aa  69.3  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  21.01 
 
 
562 aa  67  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  22.98 
 
 
465 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  22.98 
 
 
465 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  21.7 
 
 
562 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  23.22 
 
 
573 aa  64.3  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  20.25 
 
 
588 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  28.24 
 
 
580 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7808  ADP-ribosylation/crystallin J1  80 
 
 
371 aa  61.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  33.73 
 
 
563 aa  61.2  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  24.71 
 
 
664 aa  59.7  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  24.89 
 
 
619 aa  58.9  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  25.38 
 
 
663 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0924  putative ADP-ribosylglycohydrolase  61.9 
 
 
379 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.897413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  34.78 
 
 
780 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  38.89 
 
 
172 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  24.02 
 
 
432 aa  56.6  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  25.63 
 
 
619 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  36 
 
 
593 aa  55.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1603  ADP-ribosylation/Crystallin J1  61.9 
 
 
363 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  22.22 
 
 
490 aa  55.1  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2308  ADP-ribosylation/Crystallin J1  58.33 
 
 
360 aa  51.6  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  35.56 
 
 
779 aa  50.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  35.56 
 
 
779 aa  50.8  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  20.87 
 
 
835 aa  50.8  0.00009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6185  ADP-ribosylation/Crystallin J1  66.67 
 
 
385 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  25.36 
 
 
612 aa  49.7  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  26.63 
 
 
201 aa  48.9  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1670  ADP-ribosylation/Crystallin J1  68.75 
 
 
315 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.820356  normal  0.114795 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  24.9 
 
 
471 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  29.27 
 
 
458 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0265  ADP-ribosylation/crystallin J1  63.64 
 
 
539 aa  48.9  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  32.81 
 
 
165 aa  48.5  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  32.1 
 
 
451 aa  48.5  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  30.43 
 
 
223 aa  48.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  23.87 
 
 
649 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2576  ADP-ribosylation/crystallin J1  55.88 
 
 
376 aa  47  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0795204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>