118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4888 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  69.74 
 
 
699 aa  1016    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  57.93 
 
 
699 aa  852    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  56.25 
 
 
695 aa  797    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  64.2 
 
 
704 aa  963    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  98.57 
 
 
697 aa  1425    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  100 
 
 
697 aa  1442    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  61.7 
 
 
707 aa  864    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  49.91 
 
 
722 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  36.59 
 
 
687 aa  359  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  34.49 
 
 
690 aa  313  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  32.4 
 
 
692 aa  311  4e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  32.63 
 
 
656 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  34.33 
 
 
659 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  33.04 
 
 
656 aa  274  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.97 
 
 
689 aa  265  3e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  31.86 
 
 
842 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.69 
 
 
772 aa  242  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.48 
 
 
700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.5 
 
 
631 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  26.83 
 
 
590 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.73 
 
 
726 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  27.11 
 
 
695 aa  139  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  27.46 
 
 
785 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.33 
 
 
641 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  25.68 
 
 
609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  25.42 
 
 
621 aa  134  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  24.78 
 
 
669 aa  132  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  29.6 
 
 
353 aa  124  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.5 
 
 
573 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  25 
 
 
696 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.33 
 
 
573 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  25.34 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  27.54 
 
 
656 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  23.12 
 
 
552 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  22.59 
 
 
596 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  22.97 
 
 
539 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  24.96 
 
 
571 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  25.37 
 
 
600 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  23.22 
 
 
561 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  23.08 
 
 
619 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  22.99 
 
 
629 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  25.04 
 
 
574 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  25.93 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  23.6 
 
 
559 aa  98.6  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.1 
 
 
584 aa  96.3  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23.9 
 
 
584 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.56 
 
 
526 aa  93.6  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  22.3 
 
 
578 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  22.28 
 
 
552 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  24.91 
 
 
573 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.7 
 
 
529 aa  85.1  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  24.41 
 
 
591 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  39 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.56 
 
 
550 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  42.86 
 
 
345 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  23.85 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  23.85 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  23.94 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.45 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.34 
 
 
600 aa  76.6  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  37.5 
 
 
301 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  34 
 
 
292 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  38.24 
 
 
305 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  25.36 
 
 
563 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  20.99 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  22.96 
 
 
562 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  20.24 
 
 
555 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  22.77 
 
 
562 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  23.17 
 
 
593 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  25.09 
 
 
835 aa  65.1  0.000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  34.95 
 
 
329 aa  60.8  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  25.32 
 
 
646 aa  60.5  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  39.56 
 
 
723 aa  60.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  35.56 
 
 
588 aa  58.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  25.68 
 
 
304 aa  58.5  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  26.59 
 
 
593 aa  58.2  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  36.56 
 
 
580 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  24.11 
 
 
606 aa  56.2  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  37.5 
 
 
573 aa  55.5  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  27.18 
 
 
342 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  24.19 
 
 
680 aa  53.9  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  26.21 
 
 
312 aa  53.5  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  32.35 
 
 
172 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  28.17 
 
 
649 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  28.77 
 
 
306 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  28.77 
 
 
306 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  28.77 
 
 
306 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  25.51 
 
 
322 aa  52.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  35.71 
 
 
499 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  28.08 
 
 
306 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  26.34 
 
 
498 aa  50.8  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  34.12 
 
 
372 aa  50.8  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  28.51 
 
 
664 aa  50.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  31.53 
 
 
780 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  28.51 
 
 
663 aa  50.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  38.55 
 
 
709 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0725  hypothetical protein  20.14 
 
 
429 aa  49.3  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.629722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  28.02 
 
 
201 aa  50.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  29.33 
 
 
161 aa  48.9  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  24.12 
 
 
432 aa  47.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>