83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4567 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  460  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  25.91 
 
 
569 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  40 
 
 
559 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.11 
 
 
555 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  25.62 
 
 
600 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  33.05 
 
 
573 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  35.71 
 
 
561 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  31.82 
 
 
689 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  29.81 
 
 
555 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  32.26 
 
 
580 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  37.36 
 
 
529 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  29.59 
 
 
582 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  25.36 
 
 
689 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  35.29 
 
 
552 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  37.76 
 
 
600 aa  55.1  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.03 
 
 
631 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  31.25 
 
 
584 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  31.25 
 
 
584 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  27.78 
 
 
585 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  29.29 
 
 
588 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  25 
 
 
578 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  35.56 
 
 
687 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  29.68 
 
 
692 aa  53.5  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  29.17 
 
 
619 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  38.16 
 
 
552 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  26.36 
 
 
539 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  31.43 
 
 
353 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  31.82 
 
 
562 aa  52.8  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  25.58 
 
 
571 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  31.82 
 
 
562 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.32 
 
 
573 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  39.51 
 
 
707 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  27.05 
 
 
465 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  27.05 
 
 
465 aa  51.6  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  32.95 
 
 
593 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  30.84 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  26.54 
 
 
574 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.68 
 
 
641 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  35.29 
 
 
842 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  33.7 
 
 
590 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  26.17 
 
 
656 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  29.71 
 
 
526 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.87 
 
 
573 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  29.9 
 
 
591 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  30.25 
 
 
696 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  27.03 
 
 
656 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  29.7 
 
 
659 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  31.63 
 
 
596 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  30.59 
 
 
709 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  35.37 
 
 
573 aa  48.9  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  25.84 
 
 
550 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  33.67 
 
 
669 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  37.04 
 
 
680 aa  48.9  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.96 
 
 
700 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  36.36 
 
 
615 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  24.75 
 
 
593 aa  48.9  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  28.04 
 
 
619 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  32.37 
 
 
564 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.43 
 
 
772 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  35.44 
 
 
699 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
785 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  37.5 
 
 
722 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  36.62 
 
 
322 aa  47  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  31.82 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  37.66 
 
 
690 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  38.89 
 
 
695 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  29.63 
 
 
695 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  22.33 
 
 
663 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  22.33 
 
 
664 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  23.98 
 
 
646 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  28.12 
 
 
621 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 
606 aa  45.4  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  28.97 
 
 
704 aa  45.1  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  33.33 
 
 
563 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  31.25 
 
 
490 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  28.44 
 
 
458 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  35.8 
 
 
699 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  31.09 
 
 
629 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  30.77 
 
 
471 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  31.82 
 
 
723 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  30 
 
 
722 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  25 
 
 
499 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  41.6  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>