78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0469 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
609 aa  1239    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.91 
 
 
641 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.15 
 
 
631 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  31.7 
 
 
695 aa  253  6e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.03 
 
 
726 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  27.72 
 
 
621 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  28.4 
 
 
629 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  29.2 
 
 
785 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  27.38 
 
 
656 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  27.36 
 
 
669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  25.57 
 
 
656 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.9 
 
 
772 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  24.22 
 
 
659 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.79 
 
 
656 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.97 
 
 
699 aa  144  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  26.35 
 
 
842 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  25.68 
 
 
697 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  27.43 
 
 
707 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  23.25 
 
 
689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  25.44 
 
 
704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  25.69 
 
 
697 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  28.09 
 
 
696 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.52 
 
 
695 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.85 
 
 
699 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  24.27 
 
 
722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  26.02 
 
 
690 aa  123  8e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.64 
 
 
573 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.32 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  26.44 
 
 
571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  26.18 
 
 
590 aa  117  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  24.43 
 
 
569 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  23.72 
 
 
687 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  24.96 
 
 
692 aa  109  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  23.36 
 
 
578 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.79 
 
 
700 aa  104  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  23.6 
 
 
539 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  32 
 
 
353 aa  89.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  22.54 
 
 
561 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  21.52 
 
 
591 aa  88.2  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  22.43 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  22.43 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  23.92 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  22.27 
 
 
619 aa  80.1  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  30.5 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.37 
 
 
555 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  23.81 
 
 
526 aa  74.3  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  24.3 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  24.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  20.5 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  22.35 
 
 
555 aa  64.7  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.37 
 
 
562 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  25.82 
 
 
465 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  21.01 
 
 
593 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  23.7 
 
 
582 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  25.5 
 
 
559 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  22.09 
 
 
619 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  23.65 
 
 
562 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  25.94 
 
 
689 aa  60.1  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.07 
 
 
573 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  25.83 
 
 
585 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  19.24 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  24.63 
 
 
580 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  25.51 
 
 
600 aa  57  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.52 
 
 
529 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  22.48 
 
 
596 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.99 
 
 
385 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  24.38 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  22.68 
 
 
723 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  21.04 
 
 
606 aa  50.4  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  27.64 
 
 
615 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  37.08 
 
 
471 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  21.71 
 
 
563 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  33.64 
 
 
172 aa  45.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  34.83 
 
 
470 aa  45.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0725  hypothetical protein  25.44 
 
 
429 aa  45.4  0.003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.629722  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  28 
 
 
498 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>