92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003237 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  51.14 
 
 		 649 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  85.99 
 
 		 663 aa  1186    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  100 
 
 		 664 aa  1379    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  35.57 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  27.28 
 
 		 723 aa  176  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  25.55 
 
 		 709 aa  144  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25.67 
 
 		 593 aa  144  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  25.18 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  31.66 
 
 		 555 aa  97.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  32.11 
 
 		 550 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  28 
 
 		 539 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  27.48 
 
 		 559 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  26.94 
 
 		 689 aa  74.3  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  26.81 
 
 		 600 aa  73.9  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  28.63 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  28.63 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 573 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  26.64 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.81 
 
 		 529 aa  69.7  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  24.36 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.36 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.46 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  24.91 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.82 
 
 		 656 aa  63.9  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  23.27 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  40.79 
 
 		 722 aa  62.4  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  23.27 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  39.73 
 
 		 172 aa  60.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.71 
 
 		 772 aa  60.1  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  24.26 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  24.11 
 
 		 585 aa  58.9  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  37.88 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.77 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  24 
 
 		 692 aa  56.2  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  32.67 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  22.99 
 
 		 842 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  25.57 
 
 		 471 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  23.26 
 
 		 629 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  26.38 
 
 		 563 aa  54.7  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  25.57 
 
 		 499 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  25.23 
 
 		 470 aa  54.3  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  33.87 
 
 		 689 aa  53.9  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  22.75 
 
 		 353 aa  53.5  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  23.91 
 
 		 659 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  23.94 
 
 		 552 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  26.81 
 
 		 596 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  25.95 
 
 		 619 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.31 
 
 		 726 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  22.59 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  29.36 
 
 		 696 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  21.98 
 
 		 569 aa  52.4  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  40.91 
 
 		 690 aa  52.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.36 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  25.1 
 
 		 612 aa  52.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.91 
 
 		 573 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  22.71 
 
 		 458 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  24.18 
 
 		 571 aa  51.6  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  28.51 
 
 		 707 aa  51.2  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  28.51 
 
 		 697 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  34.15 
 
 		 588 aa  50.8  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  26.29 
 
 		 552 aa  50.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  28.51 
 
 		 697 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  23.13 
 
 		 573 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  21.4 
 
 		 432 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  40.24 
 
 		 580 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  35.9 
 
 		 498 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  37.7 
 
 		 491 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  30.85 
 
 		 578 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  34.4 
 
 		 601 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  44.3 
 
 		 687 aa  47.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  27.27 
 
 		 451 aa  47.8  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  32.08 
 
 		 779 aa  47.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  32.08 
 
 		 779 aa  47.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  23.28 
 
 		 695 aa  47.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  22.33 
 
 		 223 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.36 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  36.23 
 
 		 322 aa  46.2  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.58 
 
 		 641 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.02 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  23.95 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  33.67 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  23.02 
 
 		 546 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  23.08 
 
 		 574 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  35.38 
 
 		 82 aa  45.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.77 
 
 		 631 aa  45.8  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  35.14 
 
 		 590 aa  44.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  29.7 
 
 		 656 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  24.18 
 
 		 835 aa  44.7  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.1 
 
 		 695 aa  44.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  31.52 
 
 		 780 aa  43.9  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.39 
 
 		 699 aa  43.9  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>