72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0986 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  766    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  31.11 
 
 
305 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  30.48 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  28.41 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  31.21 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  36.67 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  29.79 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  34.17 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  27.87 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  26.87 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  30.2 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  34.51 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  36.75 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  27.41 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  25 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  25.24 
 
 
351 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  27.27 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  30.99 
 
 
322 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  26.76 
 
 
309 aa  63.9  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  28.77 
 
 
370 aa  63.2  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  35.48 
 
 
707 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  25.85 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  31.5 
 
 
306 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  31.5 
 
 
306 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  31.5 
 
 
306 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  30 
 
 
365 aa  59.7  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  28.78 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  30.77 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  35.71 
 
 
704 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  29.1 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  34.43 
 
 
362 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  38.2 
 
 
306 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  24.48 
 
 
354 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  33.04 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  34.29 
 
 
245 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  26.57 
 
 
428 aa  56.2  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  39.22 
 
 
272 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0953  hypothetical protein  24.37 
 
 
424 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  29.27 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  24.73 
 
 
995 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  32.31 
 
 
695 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  24.74 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  24.74 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  24.74 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  25.81 
 
 
426 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  25.27 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1012  hypothetical protein  29.05 
 
 
290 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  26.11 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  24.76 
 
 
361 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  30.25 
 
 
248 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.49 
 
 
699 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  26.13 
 
 
357 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  26.4 
 
 
363 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  34.12 
 
 
697 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  25.26 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  34.94 
 
 
697 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3568  type III restriction protein res subunit  29 
 
 
802 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.427174  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  22.25 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  30 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  32.32 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  27.1 
 
 
950 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  24.53 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  31.82 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0616  Type I site-specific deoxyribonuclease  28 
 
 
783 aa  47  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1537  type III restriction protein res subunit  29 
 
 
776 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  26.98 
 
 
1036 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  23.98 
 
 
797 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  29.09 
 
 
249 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.66 
 
 
699 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  25 
 
 
1058 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  29.82 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.52 
 
 
1020 aa  42.7  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>