48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0510 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  701    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  58.06 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  35.61 
 
 		 380 aa  90.1  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  34.83 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  34.27 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  35.29 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  36.29 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  35.76 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  37.5 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  38.81 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  34.85 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  39.83 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  32.65 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  31.73 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  30.2 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  33.51 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  35.2 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  41.12 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  31.49 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  29.06 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  30.2 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  41.24 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  26.78 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  31.03 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  36.75 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  33.9 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  30.36 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  31.88 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  36.84 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  30.61 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  38.26 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  30.71 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2914  hypothetical protein  29.37 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1605  hypothetical protein  29.59 
 
 		 236 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2724  hypothetical protein  32.53 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380628  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  27.37 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  28.89 
 
 		 995 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1648  hypothetical protein  31.9 
 
 		 225 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000109208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  29.55 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1012  hypothetical protein  33.77 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840364  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4557  hypothetical protein  31.58 
 
 		 249 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.515775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2199  negative regulator of replication initiation  30.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0698  hypothetical protein  35.53 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  48.08 
 
 		 85 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2274  replication initiation regulator SeqA  25.88 
 
 		 179 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00129565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>