40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0961 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  75.56 
 
 		 356 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  75.56 
 
 		 356 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  75.56 
 
 		 356 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  71.19 
 
 		 353 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  71.23 
 
 		 357 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  61.98 
 
 		 362 aa  478  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  59 
 
 		 361 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  55.31 
 
 		 361 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  54.97 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  54.7 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  52.05 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  52.49 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  50.56 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  47.49 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  45.92 
 
 		 365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  48.87 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  46.01 
 
 		 426 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  43.33 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  46.26 
 
 		 374 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  44.38 
 
 		 356 aa  322  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  46.46 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  42.49 
 
 		 355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  42.33 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  38.74 
 
 		 378 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  45.52 
 
 		 281 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  37.11 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  37.72 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  34.3 
 
 		 380 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  34.47 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  41.43 
 
 		 245 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  31.06 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  27.97 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  56.58 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  42.34 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  41.24 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  31.03 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  24.48 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  24.03 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0953  hypothetical protein  28.8 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>