40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3124 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 363 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  58.22 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  59.23 
 
 		 364 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  57.94 
 
 		 356 aa  437  1e-121  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  51.76 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  53.07 
 
 		 357 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  48.89 
 
 		 357 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  47.8 
 
 		 426 aa  352  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  46.67 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  46.67 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  46.39 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  47.37 
 
 		 361 aa  349  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  46.43 
 
 		 362 aa  348  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  46.99 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  46.96 
 
 		 374 aa  345  8.999999999999999e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  47.78 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  46.85 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  45.88 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  43.33 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  45.48 
 
 		 356 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  42.51 
 
 		 375 aa  322  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  44.44 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  41.48 
 
 		 370 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  42.27 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  42.38 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  39.29 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  38.53 
 
 		 380 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  36.97 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  36.23 
 
 		 281 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  47.06 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  28.72 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  31.6 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  32.21 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  57.14 
 
 		 85 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  35 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  31.49 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  26.4 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  27.5 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 		 268 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  27.78 
 
 		 995 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>