243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1333 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  100 
 
 
995 aa  2027    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  40.7 
 
 
1058 aa  701    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  54.29 
 
 
1036 aa  1083    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  37.87 
 
 
950 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  32.13 
 
 
1020 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.1 
 
 
836 aa  404  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.69 
 
 
974 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  37.98 
 
 
1147 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.67 
 
 
1154 aa  323  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  33.24 
 
 
1426 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  31.59 
 
 
1120 aa  313  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  29.63 
 
 
1209 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  35.4 
 
 
1299 aa  277  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  32.06 
 
 
1177 aa  273  1e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  40.95 
 
 
1338 aa  269  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  29.29 
 
 
1076 aa  266  1e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  34.33 
 
 
1159 aa  238  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  33.47 
 
 
1244 aa  227  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  32.8 
 
 
1257 aa  222  3e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  33.41 
 
 
410 aa  215  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.93 
 
 
795 aa  209  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  26.87 
 
 
684 aa  188  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.89 
 
 
1612 aa  176  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0993  hypothetical protein  22.34 
 
 
826 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  30.29 
 
 
416 aa  155  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  27.99 
 
 
1132 aa  153  1e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.99 
 
 
1432 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  25.86 
 
 
518 aa  136  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.05 
 
 
1256 aa  134  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  22.97 
 
 
1170 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  27.02 
 
 
557 aa  128  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  26.82 
 
 
404 aa  127  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.97 
 
 
1041 aa  126  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  25.74 
 
 
629 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  34.07 
 
 
247 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  27.72 
 
 
562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  23.93 
 
 
1252 aa  119  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2211  hypothetical protein  42.75 
 
 
162 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00033176  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  29.26 
 
 
1125 aa  108  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  24.73 
 
 
1186 aa  105  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  25.6 
 
 
1178 aa  105  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  26.9 
 
 
1104 aa  104  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  21.86 
 
 
1209 aa  104  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.92 
 
 
792 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  26.79 
 
 
1195 aa  99  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  22.15 
 
 
694 aa  95.5  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  24.62 
 
 
816 aa  94.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  22.54 
 
 
652 aa  94  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  21.38 
 
 
1189 aa  92  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  24.95 
 
 
1002 aa  91.3  9e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  22.46 
 
 
1194 aa  90.9  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0394  hypothetical protein  30.29 
 
 
1581 aa  90.1  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  24.74 
 
 
493 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.98 
 
 
746 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  25.14 
 
 
1022 aa  83.2  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  24.94 
 
 
570 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  22.49 
 
 
1038 aa  82.4  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  23.64 
 
 
1184 aa  81.6  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  29.06 
 
 
1039 aa  80.5  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  21.72 
 
 
1016 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.95 
 
 
1231 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  23.5 
 
 
1171 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  24.22 
 
 
908 aa  80.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  24.8 
 
 
978 aa  79  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  24.22 
 
 
1282 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0884  hypothetical protein  24.6 
 
 
1290 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  23.19 
 
 
1160 aa  78.2  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  25.76 
 
 
1422 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1300  hypothetical protein  23.61 
 
 
1282 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  21.49 
 
 
1233 aa  76.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2063  hypothetical protein  27.7 
 
 
332 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0829013  decreased coverage  0.00107186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0465  hypothetical protein  24.18 
 
 
1347 aa  75.5  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  23.97 
 
 
1222 aa  75.1  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  22.36 
 
 
1131 aa  75.1  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  22.87 
 
 
1182 aa  74.7  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  28.23 
 
 
1338 aa  73.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  22.36 
 
 
1180 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  23.12 
 
 
1210 aa  74.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  32.24 
 
 
1088 aa  73.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1713  adenine-specific DNA methyltransferase  24.15 
 
 
478 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0736948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  22.43 
 
 
612 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  27.95 
 
 
1055 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  22.29 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  24 
 
 
1239 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1062  hypothetical protein  22.56 
 
 
1231 aa  71.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000818904  hitchhiker  0.00000512763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  22.02 
 
 
1183 aa  70.9  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  34.51 
 
 
838 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2538  hypothetical protein  25.08 
 
 
1243 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136229  hitchhiker  0.00255392 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  27.16 
 
 
1366 aa  70.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.16 
 
 
1338 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  23.03 
 
 
1140 aa  69.7  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  26.17 
 
 
1339 aa  68.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2544  hypothetical protein  27.03 
 
 
1346 aa  68.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0868504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  26.05 
 
 
1336 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  19.6 
 
 
673 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2727  hypothetical protein  24.59 
 
 
1363 aa  66.6  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0332974  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  24.23 
 
 
732 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  23.18 
 
 
1298 aa  66.2  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  22.45 
 
 
1162 aa  66.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  22.55 
 
 
1174 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>