34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0839 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  577  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  43.66 
 
 
362 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  43.54 
 
 
351 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  45.52 
 
 
354 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  44.61 
 
 
355 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  43.8 
 
 
356 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  43.8 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  43.8 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  42.7 
 
 
426 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  44.17 
 
 
363 aa  232  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  42.5 
 
 
374 aa  232  6e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  42.7 
 
 
353 aa  232  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  42.75 
 
 
357 aa  230  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  43.46 
 
 
363 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  41.43 
 
 
361 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  40.93 
 
 
361 aa  221  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  39.93 
 
 
370 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  41.55 
 
 
364 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  39.19 
 
 
375 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  37.64 
 
 
362 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  39.85 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  39.23 
 
 
356 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  36.23 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  37.23 
 
 
365 aa  188  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  37.36 
 
 
357 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  33.8 
 
 
378 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  32.78 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  30.45 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  30.31 
 
 
382 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  30.18 
 
 
347 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  31.77 
 
 
245 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.77 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25.28 
 
 
394 aa  61.6  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  29.23 
 
 
349 aa  42.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>