44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0879 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  100 
 
 
394 aa  785    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  41.28 
 
 
347 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  45.11 
 
 
245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  32.34 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  36.71 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  36 
 
 
380 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  35.9 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  33.2 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  34.6 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  28.48 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  31.97 
 
 
365 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  29.74 
 
 
374 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  27.73 
 
 
426 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  29.61 
 
 
395 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  32.21 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  29.06 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  31.27 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  33.17 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  33.17 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  33.17 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  29.36 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  25.87 
 
 
363 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  26.43 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  27.97 
 
 
354 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  26.46 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  25.86 
 
 
355 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  29.21 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  30.62 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  25.6 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  25.4 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  30.17 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  25.28 
 
 
281 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  23.19 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  25 
 
 
306 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  25 
 
 
306 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  25 
 
 
306 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  25.23 
 
 
322 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  22.25 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  22.33 
 
 
306 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  25.23 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  23.58 
 
 
697 aa  43.5  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  22.64 
 
 
697 aa  43.1  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>