24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0792 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  634    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  99.35 
 
 
309 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  57.23 
 
 
305 aa  364  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  58.25 
 
 
304 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  49.84 
 
 
306 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  49.84 
 
 
306 aa  308  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  49.51 
 
 
306 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  49.51 
 
 
306 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  47.4 
 
 
322 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  49.06 
 
 
329 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  36.22 
 
 
342 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  35.67 
 
 
312 aa  203  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  35.86 
 
 
292 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  34.87 
 
 
292 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  26.77 
 
 
301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  28.48 
 
 
305 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  28.48 
 
 
584 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  26.76 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  29.92 
 
 
707 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  27.03 
 
 
345 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.14 
 
 
699 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  28.18 
 
 
697 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  28.18 
 
 
697 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>