26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4780 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  99.35 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  99.35 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  99.67 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  55.83 
 
 		 322 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  54.58 
 
 		 304 aa  349  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  51.97 
 
 		 305 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  53.46 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  50.16 
 
 		 309 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  49.84 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  34.94 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  34.71 
 
 		 342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  34.21 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  26.64 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  35.34 
 
 		 584 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  31.5 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0936  hypothetical protein  27.97 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.677914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  28.77 
 
 		 697 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  33.87 
 
 		 707 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.77 
 
 		 699 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  34.65 
 
 		 697 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  25 
 
 		 394 aa  50.1  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.25 
 
 		 699 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  37.5 
 
 		 704 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>