17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2610 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2610  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1199    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000187127  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0601  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0164  hypothetical protein  29.9 
 
 		 305 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4928  transporter  35.34 
 
 		 306 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.262598  normal  0.517515 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4780  transporter  35.34 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4877  transporter  35.34 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.793173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4854  transporter  35.34 
 
 		 306 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3596  hypothetical protein  31.17 
 
 		 329 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000023029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0258  hypothetical protein  26.46 
 
 		 322 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000528342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0844  hypothetical protein  29.14 
 
 		 309 aa  97.1  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0792  hypothetical protein  28.48 
 
 		 309 aa  94.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.434836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0443  hypothetical protein  27.11 
 
 		 312 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1159  hypothetical protein  25.51 
 
 		 342 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569694  normal  0.0202487 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0020  hypothetical protein  28.89 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.951877  hitchhiker  0.00117666 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0038  hypothetical protein  28.06 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4398  hypothetical protein  24.08 
 
 		 301 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3514  hypothetical protein  23.24 
 
 		 305 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>